自动冲孔机主要是为生产电路板、线路板、印刷板、菲林板和薄膜开关的企业使用，还有些企业生产的冲孔机主要为鞋类或者印刷类企业冲孔而用，等等。冲床与自动冲孔机的加工对象很大程度上是相似的，冲床分为普通冲床、快速冲床等，由于冲床需要一个送料系统，所以体积一般都比较庞大。
冲孔机是冲床的进一步发展，它解决了冲床需要独立送料系统的问题，所以体积较小。普通冲孔机无自动定位系统，相当于一个解决了送料问题的小型冲床。自动冲孔机在普通冲孔机的基础上增加了自动定位系统，大大提高了冲孔的精度和速度，可以理解为是一台自动控制的高精小型冲床。
由于冲孔机从研发到今天只有不到二十年的时间，在国内的发展更是只有十几年，所有目前还有很多不完善的地方，更没有一个统一的行业标准，所以目前光是名称就有十几种：一般准确的叫法称为冲孔机，又叫CCD冲孔机，很多人叫做打靶机，台湾、广东一带称为穿孔机、穿眼机或者点眼机，还有很多人称为射孔机、冲靶机等，其实都是指的同一种产品。自动冲孔机按照自动化程度可分为手动冲孔机、自动定位/对位冲孔机、全自动冲孔机、超级全自动冲孔机等。按照加工对象的不同可分为软板冲孔机和薄膜开关冲孔机。